根据相关法律规定，公安部门可以扣留违法犯罪行为的挖掘机，但必须严格遵守法律程序和保障公民权益。

根据相关法律规定，公安部门在执行公务过程中有权对涉嫌违法犯罪行为的挖掘机进行扣留。这是为了维护社会秩序和保障公共安全。在执法过程中，公安部门必须严格依法行政，不能滥用职权或侵犯公民合法权益。如果挖掘机存在违法违规情况，公安部门有权扣留并进行相应处理。而如果挖掘机的所有人对扣留有异议，可以通过法律途径提出申诉。总的来说，公安部门有权扣留挖掘机操作，但必须在法律框架内进行。